Для климата здешних мест характерны резкие температурные контрасты. У подножия хребта Зигальга климат континентальный, а на вершине - субарктический.
Количество осадков на Зигальге может достигать 1000 мм. Большая часть осадков приходится на теплое время года. В июле – самом дождливом месяце – выпадает 90-110 мм.
Зимой осадков значительно меньше, в феврале всего 15-22 мм. Высота снежного покрова 60-90см. Столбик термометра в суровые зимы опускается до отметки -48°С.
Примерно третья часть всех осадков на Зигальге являются горизонтальными – туман, изморось, иней. Конденсационная атмосферная влага очень важна для питания зигальгинских болот.
Кол-во солнечных часов 1 550-1 600.
Вегетационный период 100-115 дней. Тепла за этот период накапливается 1500-1800°.